古代の錬金術の伝説には、ある物質が存在しました。それを使用すると、劣った金属を金に変えることができると言われています。さらに、その物質の最も魅力的な側面は、それを使用すると不老不死になれると伝えられています。この物質は賢者の石と呼ばれています。以前、ほとんどの錬金術師はそれが幻想にすぎないと考えていました。

100年以上前、有名な錬金術師の自伝に、彼が賢者の石を作るために21年かけて原料を探し求めたという記述がありました。そして、最後に彼は幸運にも見つけ出し、作り上げることができました。この大錬金術師は余生を賢者の石の研究に費やし、最終的に不老不死の力を手に入れました。そして、この伝説が物語の始まりとなりました。

大錬金術師の伝説から100年以上経った今、賢者の石を合成することは、すべての錬金術師の夢でありながら、誰も成功していませんでした。しかし、後に冯・ホーンハイムという名の天才錬金術師が現れました。彼は若くして国家レベルの錬金術師になり、その業績は広く知られていました。特に彼は卓越した錬金術を使って人工の生命を創り出したことで有名です。人々はそれを「フラスコの中の小人」と呼びました。実際には、彼が賢者の石を手に入れた2人目であるという説を後世の人々はより信じる傾向がありました。